ГлавбухОК
Проверки и риски · 8 августа 2026 г.

МИС и софт за счёт ОМС: когда это нецелевые расходы

7 августа 2026 года вышел очередной обзор судебной практики по средствам ОМС, и вывод в нём неприятный: расходы клиники на сопровождение медицинской информационной системы, понесённые до 2025 года, признаны нецелевыми. При этом годом ранее другой суд по схожему спору решил обратное. Противоречия здесь нет: программное обеспечение из структуры тарифа не исключено — оно прямо названо в ч. 7 ст. 35 Федерального закона от 29.11.2010 № 326-ФЗ, а раздел о порядке оплаты МИС появился в методических рекомендациях Минздрава и ФФОМС только с 2025 года. До этого клиника доказывала связь расходов с медпомощью сама, и получалось не у всех. Ниже — три условия, при которых оплата софта из ОМС бесспорна, расчёт распределения по источникам и лимит, который большинство справочников до сих пор указывает неверно.

Почему по одному и тому же вопросу решения разные

ПериодЧто было основаниемТипичный исход спора
До 2025 годаТолько общая формулировка ч. 7 ст. 35 № 326-ФЗФонд оспаривает, клиника доказывает связь с медпомощью. Практика разнонаправленная
С 2025 годаПоявился раздел об оплате МИС в методрекомендациях Минздрава и ФФОМСЕсть прямой порядок: три условия и правило распределения
С 2026 годаДействующая редакция — письмо Минздрава России от 24.02.2026 № 31-2/И/2-3021 (ред. от 03.04.2026)Спор смещается с «можно ли» на «выполнены ли условия»

Показательный пример из практики переходного периода — постановление Восемнадцатого арбитражного апелляционного суда от 18.06.2025 по делу № А34-10279/2024. Больница оплатила из средств ОМС техническое и сервисное сопровождение региональной МИС. Контролёры заявили, что обслуживание системы не является мероприятием по поддержанию или восстановлению здоровья граждан и медпомощь теоретически можно оказать и без неё. Суд с этим не согласился: МИС обеспечивает учёт пациентов, ведение электронных медицинских карт, распределение коечного фонда и формирование реестров счетов для территориального фонда — то есть непосредственно участвует в реализации территориальной программы. Расходы признали целевыми.

Вывод для клиники: исход спора решает не сам факт покупки софта, а объём доказательств связи системы с медпомощью по ОМС.

Три условия, при которых МИС оплачивается из ОМС

1. У клиники есть права на программный продукт. Исключительные или неисключительные — но подтверждённые: лицензионный договор, договор об отчуждении права, сублицензия. Договор «на обслуживание» без указания предоставленных прав — слабая позиция.

2. ПО принято к балансовому учёту. Нематериальный актив или право пользования должно быть отражено в учёте. Расход, который нигде не числится, фонд трактует как оплату чужого актива.

3. Расходы распределены пропорционально всем источникам дохода. Это самое частое нарушение. Клиника, у которой есть ОМС, ДМС и платные услуги, не вправе оплачивать общую для всех направлений систему целиком из ОМС.

Отдельно: развитие государственной информационной системы здравоохранения субъекта РФ финансируется из регионального бюджета, а не из ОМС. Ваша собственная МИС — из ОМС в допустимой доле, региональная ГИСЗ — нет.

Пример расчёта: как распределить лицензию

Клиника работает в ОМС, принимает пациентов по ДМС и оказывает платные услуги. Выручка за год: ОМС — 62 млн ₽, ДМС — 15 млн ₽, платные — 23 млн ₽. Итого 100 млн ₽. Годовая лицензия на МИС и её сопровождение — 900 000 ₽.

Источник доходаВыручкаДоляДоля расхода на МИС
ОМС62 000 000 ₽62%558 000 ₽
ДМС15 000 000 ₽15%135 000 ₽
Платные услуги23 000 000 ₽23%207 000 ₽
Итого100 000 000 ₽100%900 000 ₽

Из средств ОМС правомерно оплатить 558 000 ₽. Если клиника заплатит все 900 000 ₽ из ОМС, нецелевым будет признано 342 000 ₽ — плюс штраф 34 200 ₽ и пени. Никакого «почти всё равно» здесь нет: фонд считает по своей же методике.

Расчёт держится на корректном раздельном учёте по источникам финансирования. Если его нет, распределить расходы будет нечем, а фонд посчитает по своему варианту — не в вашу пользу. Как построить такой учёт, разобрано в статье «Раздельный учёт ОМС, ДМС и платных услуг в клинике».

Лимит 400 000 ₽, а не 100 000 ₽

Структура тарифа ограничивает приобретение основных средств — оборудования, производственного и хозяйственного инвентаря — суммой 400 000 ₽ за единицу. Многие справочники, бухгалтерские блоги и даже методички до сих пор повторяют старую цифру в 100 000 ₽, которая не менялась с 2013 года и была повышена поправками в ч. 7 ст. 35 № 326-ФЗ.

Практический смысл для клиники двойной:

  • Не занижайте свои возможности. Оборудование за 350 000 ₽ можно приобрести за счёт ОМС, если оно используется в оказании помощи по программе. Отказываться от этого из-за устаревшей цифры — терять деньги.
  • Не дробите договор. Попытка разбить одну единицу оборудования на несколько договоров, чтобы уложиться в лимит, — известный фондам приём. Единицей считается инвентарный объект, а не строка в счёте.

Лицензии и услуги сопровождения под этот лимит обычно не подпадают: они проходят по строкам «программное обеспечение и прочие услуги» и «работы и услуги по содержанию имущества», а не как приобретение основных средств. Правильная квалификация в договоре и акте здесь важнее суммы.

Что грозит, если ошибиться

Возврат всей нецелевой суммы — в течение 10 рабочих дней со дня требования территориального фонда.

Штраф 10% от суммы нецелевого использования по ч. 9 ст. 39 № 326-ФЗ. Добровольный возврат после составления акта проверки его не отменяет.

Пени 1/300 ставки рефинансирования за каждый день просрочки — при длительном споре они догоняют основную сумму. Как эти три платежа складываются на практике, видно в разборе дела, где с клиники взыскали 74,4 млн ₽: «Нецелевое использование ОМС: 74 млн с клиники за иногородних».

Кассовый разрыв. Требование фонда исполняется за 10 рабочих дней и не ждёт, пока вы оспорите его в суде. Для клиники с оборотом в десятки миллионов возврат нескольких миллионов в такой срок — это уже вопрос ликвидности, а не бухгалтерии.

Чек-лист: проверьте у себя за час

  1. Поднимите все договоры на ПО за последние три года — МИС, лабораторная система, телемедицина, бухгалтерская программа, антивирус, хранение данных.
  2. Проверьте формулировку предмета. В договоре должно быть видно, что именно вы приобрели: право использования, услугу сопровождения или основное средство. От этого зависит строка структуры тарифа.
  3. Найдите документ о принятии ПО к учёту. Нет карточки актива или права пользования — восстановите.
  4. Проверьте, как распределялся каждый платёж. Если весь расход отнесён на ОМС, а у клиники есть платные услуги, — это готовая претензия фонда.
  5. Отделите региональную ГИСЗ от собственной МИС. Работы по подключению к государственной системе оформляйте отдельными этапами и актами.
  6. Проверьте оборудование, купленное за счёт ОМС. Убедитесь, что стоимость единицы укладывается в 400 000 ₽ и что объекты не «разрезаны» на части ради лимита.
  7. Сверьте лимиты и порядок с действующим тарифным соглашением региона. Территориальные соглашения детализируют структуру тарифа, и именно на них ссылается фонд при проверке.

Коротко

Оплачивать медицинскую информационную систему из средств ОМС можно — программное обеспечение прямо входит в структуру тарифа. Но клиника обязана доказать три вещи: что права на продукт у неё есть, что актив стоит на учёте и что расходы распределены между ОМС, ДМС и платными услугами пропорционально выручке. До 2025 года порядок был не описан, и суды решали по-разному — отсюда свежее решение о нецелевом характере старых расходов. Сегодня правила есть, и спор о деньгах превращается в спор о документах. Значит, выигрывается он заранее — на этапе договора и учётной политики, а не в суде.

Мы ставим раздельный учёт по источникам финансирования и проверяем структуру расходов до того, как это сделает фонд, — бухгалтерское обслуживание медицинских клиник.

Ставки и нормы в статье проверены по состоянию на 8 августа 2026 года: ч. 7 ст. 35 Федерального закона от 29.11.2010 № 326-ФЗ (структура тарифа, программное обеспечение и прочие услуги, приобретение основных средств стоимостью до 400 000 ₽ за единицу), ч. 9 ст. 39 № 326-ФЗ (возврат нецелевых средств, штраф 10%, пени 1/300 ставки рефинансирования), методические рекомендации по способам оплаты медицинской помощи за счёт средств ОМС — письмо Минздрава России от 24.02.2026 № 31-2/И/2-3021 (ред. от 03.04.2026), раздел об оплате расходов на медицинскую информационную систему, постановление Восемнадцатого арбитражного апелляционного суда от 18.06.2025 по делу № А34-10279/2024.

Оксана Шатунова
Оксана Шатунова
Основатель и директор, аттестованный налоговый консультант · 30 лет в бухгалтерии и налогах
Опубликовано: 8 августа 2026 г.
ставки проверены · актуально на 8 августа 2026

Вопросы по теме

Мы оплатили лицензию на МИС полностью из средств ОМС. Это нарушение? +

Скорее всего да, если клиника оказывает не только помощь по ОМС. Требование методических рекомендаций Минздрава — распределять расходы на техническое сопровождение МИС пропорционально всем источникам дохода медицинской организации. Если 40% выручки приходится на платные услуги и ДМС, то и 40% стоимости лицензии должны быть оплачены из этих денег, а не из ОМС. Полная оплата из ОМС — это ровно та часть, которую фонд потребует вернуть.

Программа стоит 550 000 ₽. Можно оплатить её из ОМС? +

Не единовременно как основное средство: структура тарифа ограничивает приобретение основных средств суммой 400 000 ₽ за единицу (ч. 7 ст. 35 № 326-ФЗ). Но лицензия на ПО и услуги по сопровождению — это чаще не основное средство, а нематериальный актив или текущие расходы на услуги, которые в структуру тарифа входят отдельной строкой. Правильная квалификация договора решает исход спора: смотрите, что именно вы покупаете — исключительное право, право пользования или услугу.

Фонд говорит, что информационная система вообще не лечит пациентов и к медпомощи отношения не имеет. Это законно? +

Такой аргумент фонды заявляют регулярно, и суды его не всегда принимают. В постановлении Восемнадцатого арбитражного апелляционного суда от 18.06.2025 по делу № А34-10279/2024 суд указал, что медицинская информационная система — это комплексная платформа автоматизации лечебно-диагностического процесса, без которой невозможно вести учёт пациентов и формировать реестры счетов для территориального фонда. Расходы признали целевыми. Ключ к такому исходу — доказательства: техническое задание, состав функционала, реестры счетов, сформированные в этой системе.

Клиника подключается к региональной ГИСЗ. Эти расходы можно взять из ОМС? +

Развитие государственных информационных систем здравоохранения субъекта финансируется из бюджета региона, а не из средств ОМС. Из ОМС оплачивается ваша собственная МИС и, при выполнении условий, работы по её интеграции. Разграничивайте это в договоре с подрядчиком: отдельные этапы и отдельные акты.

Что будет, если фонд признает расходы нецелевыми? +

Возврат всей суммы в течение 10 рабочих дней со дня требования фонда, штраф 10% от суммы нецелевого использования и пени в размере 1/300 ставки рефинансирования за каждый день просрочки (ч. 9 ст. 39 № 326-ФЗ). Возврат средств сам по себе штраф не отменяет. Механика санкции подробно разобрана в нашей статье о взыскании 74 млн ₽ с частной клиники.

Хотите так же, но для вашей компании?

Проверим ваши льготы, посчитаем экономию и возьмём учёт на себя. Первая консультация — бесплатно.

Написать в Telegram