ГлавбухОК
Проверки и риски · 1 сентября 2026 г.

Медкарта в электронном виде: приказ 209н с 1 сентября

Заведующая говорит, что пора уходить от бумажных карт, айтишник МИС кивает, а вы считаете, во что обойдётся подпись для каждого врача. С 1 сентября 2026 года у этого разговора появилось новое основание: заработал обновлённый порядок ведения медицинской документации в форме электронных документов — приказ Минздрава России от 25.03.2026 № 209н, зарегистрированный Минюстом 22 апреля. Он заменил приказ № 947н от 07.09.2020 и рассчитан до 1 сентября 2032 года. Хорошая новость сразу: переходить никто не заставляет. Плохая — если переходите, порядок соблюдается целиком, а половина требований в нём про подписи и реестры, то есть про людей и деньги.

Что изменилось по сравнению с прежним порядком

ЧтоПриказ № 947нПриказ № 209н
Срок действияС 01.02.2021, шесть летС 01.09.2026 до 01.09.2032
Где создаётся документИнформационные системы медорганизацииЕГИСЗ названа прямо как площадка создания ЭМД
ПодписиОбщие требованияУКЭП каждого работника, создавшего документ; формат контейнера — CMS
Печать организацииАналог не был описан явноЕсли бумажный документ требовал печати — вторая подпись руководителя или уполномоченного лица
Аптеки и фармработникиУпоминались фрагментарноПорядок распространён на них прямо; бумажную копию пациент может получить и в аптеке
Регистрация в РЭМДСроки размытыВ течение одного рабочего дня со дня создания документа

Ещё одно требование звучит технически, а на практике упирается в отдел кадров: работник, подписывающий электронный медицинский документ, должен быть внесён в Федеральный регистр медицинских работников, а сама организация — в реестр медорганизаций. Врач, который вышел на работу три недели назад и до сих пор не заведён в ФРМР, электронный протокол приёма просто не подпишет.

Почему это вопрос к бухгалтеру, а не только к главврачу

Медицинская карта — не только клинический документ. Это первичка, на которой держатся две главные налоговые конструкции частной клиники.

Освобождение от НДС. Медицинские услуги не облагаются НДС по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ, если они входят в перечень, утверждённый постановлением Правительства РФ от 20.02.2001 № 132, и у клиники есть лицензия. При споре с инспекцией доказательством служит документация: что за услуга, кому, кем оказана. Подробно разбирали в статье «НДС на медицинские услуги: как работает освобождение».

Ставка налога на прибыль 0%. По ст. 284.1 НК РФ нужны одновременно лицензия, доля медицинских доходов не менее 90%, не менее 15 работников в штате непрерывно и не менее 50% медперсонала с сертификатом специалиста или свидетельством об аккредитации — тоже непрерывно в течение налогового периода. Сведения о сертификатах и аккредитациях живут в ФРМР. Тот самый реестр, без записи в котором врач не может подписать электронный документ.

Получается редкий случай, когда наведение порядка в кадровом реестре приносит пользу дважды: документооборот начинает работать, а условие льготы становится подтверждаемым не справкой на коленке, а федеральным реестром.

Сколько это стоит и куда это относить

Считать надо три статьи: доработка или замена МИС, интеграция с ЕГИСЗ и РЭМД, электронные подписи для медработников.

Пример. Клиника, 24 сотрудника, из них 16 медработников, подписывающих документы. Подставьте свои цены — здесь для наглядности взяты условные 2000 ₽ за годовой сертификат.

СтатьяРасчётСумма за первый год
Сертификаты УКЭП для медработников16 × 2000 ₽32 000 ₽
Доработка МИС под требования порядкаЕдиновременно180 000 ₽
Интеграция и сопровождение15 000 ₽ × 12180 000 ₽
Итого392 000 ₽

Куда это относится:

  • ОСНО: программы для ЭВМ и базы данных — пп. 26 п. 1 ст. 264 НК РФ, прочие затраты — пп. 49 п. 1 ст. 264 НК РФ.
  • УСН «Доходы минус расходы»: права на использование программ и баз данных и их обновление — пп. 19 п. 1 ст. 346.16 НК РФ.
  • УСН «Доходы» 6%: расходы не учитываются, эти 392 000 ₽ налог не уменьшат ничем.
  • ОСНО со ставкой 0%: налог и так ноль, поэтому экономии на расходах нет. Считайте смету по полной стоимости, а не «минус налог». Та же логика подробно разобрана в статье «Санитарные правила СП 2.1.4284-26: что клинике сделать в сентябре».

Отдельный вопрос, который задают почти всегда: если клиника оплачивает сертификат подписи для врача, возникает ли у врача доход? На наш взгляд — нет. Подпись нужна для исполнения трудовых обязанностей и используется в интересах работодателя, экономической выгоды у работника здесь не возникает (ст. 41 НК РФ). Позиция рабочая, но подтвердите её внутренним документом: приказом о переходе на электронный документооборот и перечнем должностей, которым подпись нужна по работе.

Что грозит, если делать наполовину

Штрафа за «не перешли на электронные карты» нет и не будет — переход добровольный. Риски другие, и они серьёзнее.

  • Лицензионные требования. Ведение медицинской документации входит в перечень лицензионных требований по постановлению Правительства РФ от 01.06.2021 № 852. Осуществление деятельности с нарушением требований — ч. 3 ст. 14.1 КоАП РФ, грубое нарушение — ч. 4 той же статьи, где предусмотрено приостановление деятельности до 90 суток.
  • Гибрид без правил. Худший сценарий — половина документов в системе, половина на бумаге, и никто не знает, где актуальная версия. При проверке качества медпомощи или при жалобе пациента восстановить картину не удастся ни вам, ни проверяющему.
  • Налоговая сторона простоя. Приостановление деятельности обнуляет медицинскую выручку, а прочие доходы — аренда, немедицинские услуги — продолжают начисляться. Доля медицинских доходов падает, и при выходе из-под 90% налог на прибыль пересчитывается по ставке 25% с начала года, с пенями. Что при этом происходит с раздельным учётом, разбирали в статье «Раздельный учёт ОМС, ДМС и платных услуг».

Чек-лист на сентябрь

  1. Решите и зафиксируйте приказом: переходите на ЭМД, переходите частично по видам документов или остаётесь на бумаге. Устная договорённость с главврачом документом не является.
  2. Сверьте список медработников с ФРМР. Все, кто будет подписывать, должны быть в реестре с действующими сведениями о сертификате или аккредитации.
  3. Заодно посчитайте долю сертифицированного медперсонала от общей численности — это условие ставки 0% проверяется непрерывно, а не на 31 декабря.
  4. Уточните у поставщика МИС, поддерживает ли система формат подписи CMS и регистрацию в РЭМД в течение одного рабочего дня.
  5. Опишите процедуру выдачи бумажной копии пациенту: кто печатает, как проставляется отметка о подписи, кто отвечает за то, что рукописных правок на копии не появится.
  6. Заложите расходы в бюджет с учётом своего режима: на УСН «Доходы» и на ставке 0% они не уменьшат налог.

С чем поможем

Мы ведём бухгалтерию частных клиник и знаем, где документооборот упирается в налоги: бухгалтерское обслуживание медицинских клиник. Если хотите проверить, выполняются ли у вас все условия ст. 284.1 НК РФ, и не потерять льготу из-за кадрового реестра — ставка 0% по налогу на прибыль.

Ставки и нормы в статье проверены по состоянию на 1 сентября 2026 года: приказ Минздрава России от 25.03.2026 № 209н (действует с 01.09.2026 до 01.09.2032, заменил приказ от 07.09.2020 № 947н); постановления Правительства РФ от 09.02.2022 № 140, от 01.06.2021 № 852 и от 20.02.2001 № 132; ст. 41, пп. 2 п. 2 ст. 149, ст. 284.1, пп. 26 и 49 п. 1 ст. 264, пп. 19 п. 1 ст. 346.16 НК РФ; ч. 3 и ч. 4 ст. 14.1 КоАП РФ; условия ставки 0% — доля медицинских доходов не менее 90%, не менее 15 работников, не менее 50% сертифицированного медперсонала; общая ставка налога на прибыль — 25%.

Оксана Шатунова
Оксана Шатунова
Основатель и директор, аттестованный налоговый консультант · 30 лет в бухгалтерии и налогах
Опубликовано: 1 сентября 2026 г.
ставки проверены · актуально на 1 сентября 2026

Вопросы по теме

Обязана ли частная клиника перейти на электронные медкарты с 1 сентября 2026 года? +

Нет. Приказ Минздрава России от 25.03.2026 № 209н устанавливает порядок для тех организаций, которые приняли решение вести медицинскую документацию в электронном виде. Решение принимает сама клиника. Обязательным остаётся другое — подключение к ЕГИСЗ и передача сведений об оказанной медицинской помощи: это требование постановления Правительства РФ от 09.02.2022 № 140, а по постановлению Правительства РФ от 01.06.2021 № 852 оно входит в лицензионные требования.

Кто и чем подписывает электронный медицинский документ? +

Медицинский или фармацевтический работник, создавший документ, подписывает его усиленной квалифицированной электронной подписью. Если документ создавали несколько работников, каждый подписывает своей УКЭП. Когда бумажный аналог документа требовал печати медицинской организации, электронный дополнительно подписывает руководитель или уполномоченное им лицо. Контейнер подписи — формата CMS.

Нужно ли дублировать электронные документы на бумаге? +

Постоянно вести два комплекта порядок не требует — в этом и смысл перехода. Бумажный экземпляр или копия формируется по запросу пациента, его законного представителя или государственного органа, и делается это за счёт медицинской организации. На такой копии проставляется отметка «ПОДПИСАНО ЭЛЕКТРОННОЙ ПОДПИСЬЮ» со сведениями о сертификате: номер, владелец, срок действия. Вносить в распечатанную копию рукописные изменения нельзя.

Как электронные медкарты связаны со ставкой налога на прибыль 0%? +

Через два условия ст. 284.1 НК РФ. Первое — доля доходов от медицинской деятельности не менее 90%: подтверждается тем, что оказанная услуга задокументирована и входит в перечень медицинских услуг. Второе — доля медперсонала, имеющего сертификат специалиста или свидетельство об аккредитации, не менее 50% в течение всего налогового периода: эти сведения хранятся в ФРМР, и они же нужны, чтобы работник вообще мог подписать электронный документ. Одна ошибка в реестре бьёт сразу по документообороту и по льготе.

Как учесть расходы на переход: МИС, интеграцию, электронные подписи? +

На ОСНО — как прочие расходы, связанные с производством и реализацией: программы для ЭВМ и базы данных по пп. 26 п. 1 ст. 264 НК РФ, остальные затраты по пп. 49 п. 1 ст. 264 НК РФ. На УСН «Доходы минус расходы» — по пп. 19 п. 1 ст. 346.16 НК РФ (права на использование программ и баз данных, их обновление) и по соответствующим подпунктам для материальных затрат и услуг связи. На УСН «Доходы» 6% расходы налог не уменьшают вообще. И отдельный контринтуитивный момент: у клиники, применяющей ставку 0%, расходы налоговой экономии не дают — смету надо считать по полной стоимости.

Что грозит, если вести электронные документы с нарушением порядка? +

Отдельного состава «нарушил приказ 209н» в КоАП РФ нет. Опасность приходит с двух других сторон. Первая — лицензионная: ведение медицинской документации входит в лицензионные требования по постановлению Правительства РФ от 01.06.2021 № 852, а осуществление деятельности с нарушением лицензионных требований — ч. 3 и ч. 4 ст. 14.1 КоАП РФ, вплоть до приостановления деятельности. Вторая — налоговая: документ, который нельзя предъявить и проверить, перестаёт подтверждать, что услуга была медицинской, и тогда под вопросом и освобождение от НДС по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ, и доля 90% для ставки 0%.

Хотите так же, но для вашей компании?

Проверим ваши льготы, посчитаем экономию и возьмём учёт на себя. Первая консультация — бесплатно.

Написать в Telegram