Освобождение от НДС для медицинской клиники: как применять

Когда медуслуги клиники освобождены от НДС

По состоянию на 2026 год медицинские услуги освобождены от НДС по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ. Освобождение работает при одновременном соблюдении двух условий: услуга входит в Перечень медицинских услуг (Постановление Правительства РФ от 20.02.2001 № 132), и у клиники есть действующая лицензия на медицинскую деятельность. Если услуги нет в перечне или лицензия отсутствует — освобождение не применяется.

Важно, что это освобождение самой операции, а не льгота по обороту. Поэтому оно действует и на ОСНО, и на УСН — в том числе когда доход клиники превысил 20 млн ₽ и на упрощёнке в общем случае возникает обязанность по НДС. Медуслуги из перечня остаются без налога независимо от режима и выручки. Общая ставка НДС с 2026 года — 22%, но медицинских услуг из перечня она не касается. Оценить, какой режим выгоднее клинике в целом, помогает калькулятор УСН/ОСНО для клиники.

Немедицинские услуги: почему нужен раздельный учёт

У большинства клиник помимо медицинских услуг есть и немедицинские: часть косметологических процедур, не входящих в перечень, и прочие услуги вне медицинской лицензии. Такие операции облагаются НДС в общем порядке — по ставке 22%. Как только у клиники появляется и освобождённая, и облагаемая деятельность, закон требует вести раздельный учёт ОМС/ДМС и налога.

Раздельный учёт касается двух вещей. Первое — выручка: её нужно разнести на освобождённую и облагаемую, чтобы по каждой части считать налог правильно. Второе — входной НДС. При освобождении входной налог к вычету не принимается и включается в стоимость приобретённого. По облагаемым операциям входной НДС можно заявить к вычету. По общим расходам, которые нельзя отнести напрямую, налог делится пропорционально. Ошибка в этом разделении — либо переплата, либо доначисление, поэтому учёт настраивают аккуратно, а не «на глаз».

Декларация по НДС при освобождении

Частое заблуждение: раз услуги освобождены — отчитываться не нужно. Это не так. Даже при полном освобождении декларация по НДС сдаётся: освобождённые операции отражаются в разделе 7 с кодом операции 1010211. Налога к уплате по ним нет, но обязанность отчитаться сохраняется. Если у клиники есть и облагаемые немедицинские услуги, в декларации заполняются и «обычные» разделы по ним.

Когда клинике нужна не эта услуга, а другая

Здесь мы решаем задачу освобождения: подтвердить право не платить налог по медуслугам и корректно развести облагаемую часть. Но если немедицинская выручка клиники — косметология вне перечня, продажа косметики, аренда кабинетов — сама по себе перевалила за 20 млн ₽, у вас появляется полноценный НДС по этой части со всеми обязанностями: счета-фактуры, книги, декларация, три платежа в квартал. Это уже другая работа, и она разобрана в услуге «Первый год с НДС на УСН» — диагностика от 3 000 ₽. Прикинуть цифры заранее можно в калькуляторе НДС на УСН.

Если не уверены, какая из двух задач ваша, — напишите нам: разберёмся по вашей структуре выручки и скажем прямо, что нужно, а что нет.

НДС — только часть учёта клиники. Полный цикл — от первички до отчётности и зарплаты персонала — закрывает бухгалтерское обслуживание клиник. Другие услуги и материалы для медицинского бизнеса собраны в разделе бухгалтерия для медклиник.